دأب بن غفير، منذ توليه منصبه، على تبني سياسات عقابية قاسية بحق الأسرى الفلسطينيين، شملت تقليص كميات الطعام والمياه، وتقييد زيارة العائلات، وتقليص مدة الاستحمام، وإلغاء امتيازات أساسية داخل الأقسام.